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全世界有数十万份小麦种质资源保存在基因库中,且小麦新审定品种数量逐年增加。对小麦种质资源精准基因分型是解锁遗传多样性、加速品种改良的首要步骤。然而,现有的分子标记检测技术仍然具有检测通量低、成本偏高、技术复杂、敏感性偏低等问题。目前,仍缺乏面向育种应用的高通量、低成本的小麦种质材料的基因型鉴定技术。
2024年6月11日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所李奎教授主编的家畜基因组编辑英文专著《Livestock Genome Editing Tools》由Elsevier旗下的Academic Press出版社出版。该书汇集了当前国内外家畜基因编辑领域最前沿的研究成果和实用技术,填补了全球农业大型动物基因组编辑领域英文专著的空白。
《Archives of Virology》 期刊 —— Complete genome sequence of a novel partitivirus with a dsRNA3 segment, isolated from Fusarium commune strain CP-SX-3 causing strawberry root rot(图)
镰刀菌 真菌病毒 种类 多样性
2024/6/14
中国人民大学统计学院李扬教授及学生在期刊Genome Biology发表论文(图)
李扬 数据分析 生物统计
2024/11/26
中国人民大学统计学院李扬教授及博士生吴明聪在《Genome Biology》发表论文,提出基于混合零膨胀负二项模型的单细胞数据聚类分析方法,能够有效控制表达数据中的技术脱落及批次混杂问题,并创新性地利用惩罚技术实现同步的高度变异基因识别,是探索细胞间的异质性及与异质性机制形成相关的基因表达研究的有力工具。研究结果显示,该方法在异质性和基因识别方面均具有一定优势。
南京农业大学农学院《Molecular Plant》发表宋庆鑫教授课题组“A telomere-to-telomere gap-free assembly of soybean genome”(图)
宋庆鑫 基因 分子育种
2023/10/28
大豆是世界重要的粮油饲兼用作物,中国是全球最大的大豆消费国和进口国,2023年来大豆供需失衡成为我国农业的重大“卡脖子”问题。基于基因组信息,克隆和解析重要农艺性状关键调控基因对于培育高产优质大豆新品种至关重要。2010年,大豆品种Williams 82的基因组被破译,成为首个大豆参考基因组。随后该基因组被多次更新,已成为广泛应用的大豆参考基因组,极大推动了大豆重要农艺性状的解析和分子育种。然而,...
引导编辑系统(Prime editor, PE)作为目前应用灵活、前景广阔的新型基因组编辑工具,可以实现植物基因组任意碱基的替换以及小片段的插入和删除,并在与位点特异性重组酶耦合时展现出高效精准大片段定点插入的潜力。由于PE在植物中的编辑效率偏低,目前虽有多项研究通过不同策略来提升植物引导编辑系统的效率,但这些改进的引导编辑器依然存在位点偏好明显、普适性较差等问题,并且大多数优化集中在水稻和玉米等...
南京农业大学农学院《Nature Communications》发表万建民院士团队“Genome-Wide association studies identify OsWRKY53 as s key regulator of salt tolerance in rice”(图)
万建民 基因 分子机制 蛋白
2023/10/28
盐碱胁迫影响水稻的生长发育、存活率与最终产量。水稻耐盐碱是由多基因控制的复杂性状。研究水稻应对盐碱胁迫的关键基因及其调控网络,对于培育耐盐碱水稻品种具有重要科学意义和应用价值。2023年6月16日,国际著名期刊Nature Communications发表了万建民院士团队在水稻耐盐碱研究上的新进展。
南京农业大学农学院《Molecular Plant》上发表王秀娥教授团队“A chromosome-scale genome assembly of Dasypyrum villosum provides insights into its application as a broad-spectrum disease resistance resource for wheat improvement”(图)
王秀娥 小麦遗传育种 基因 栽培
2023/10/28
2023年2月6日,南京农业大学农学院细胞遗传研究所作物遗传与种质创新国家重点实验室小麦遗传育种创新团队在《Molecular Plant》杂志上发表了题为“A chromosome-scale genome assembly of Dasypyrum villosum provides insights into its application as a broad-spectrum disea...
于典司(2021)Genetic diversity and population structure of popcorn germplasm resources using genome-wide SNPs through genotyping-by-sequencing (图)
爆米花 遗传多样性 SNP 爆裂玉米
2023/2/27
上海市农业科学院作物育种栽培研究所玉米研究中心郑洪建团队在Genetic Resources and Crop Evolution发表了题为“Genetic diversity and population structure of popcorn germplasm resources using genome-wide SNPs through genotyping-by-sequencing...
于典司(2021)Genome-wide Comparative Analysis of Genetic Diversity of Regular and Specialty Maize Germplasms through Genotyping by Target Sequencing (GBTS) (图)
特用玉米 玉米种质 全基因组 GBTS
2023/2/27
上海市农业科学院作物育种栽培研究所玉米研究中心郑洪建团队在Plant Molecular Biology Reporter发表了题为“Genome-wide Comparative Analysis of Genetic Diversity of Regular and Specialty Maize Germplasms through Genotyping by Target Sequenci...
南京农业大学农学院《Genome Biology》发表多倍体团队“Small RNAs mediate transgenerational inheritance of genome-wide trans-acting epialleles in maize”(图)
多倍体 遗传变异 植物育种
2022/3/23
杂交和回交是常用的动、植物育种手段。杂交引起的父母基因互作导致遗传和表观遗传变异,比如经典的副突变(paramutation)可以跨代遗传。但是,由表观遗传引起的跨代遗传的机理缺乏全基因组水平上的研究。2月9日,南京农业大学多倍体杂种优势研究团队在Genome Biology(IF=13.583)上发表了题为Small RNAs mediate transgenerational inherita...