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基于16S rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究
小贯小绿叶蝉 细菌 16S rDNA 多样性
2018/6/26
利用Illumina HiSeq技术, 对赤壁、大悟、武汉、咸安和英山5个茶园小贯小绿叶蝉地理种群的成虫共生细菌16S rDNA-V4变异区进行测序, 应用Uparse和RDP Classifier等软件统计和分析样本的物种组成、丰度和多样性。5个地区小贯小绿叶蝉成虫的16S rDNA基因序列文库共获得239 645条有效tags, 在97%相似阈值下将其聚类为3 403个OTUs。共注释到41个...
Wolbachia是一类胞质遗传的内共生菌, 广泛分布于节肢动物和其他动物中, 与宿主的生殖调控密切相关。通过研究迁飞性害虫稻纵卷叶螟Cnaphalocrocis medinalis (Guenée)的Wolbachia感染情况, 为探讨Wolbachia在迁飞性昆虫中的生殖调控和传递方式等提供基础资料。本研究应用Wolbachia的ftsZ基因和16S rDNA基因的特异性引物, 通过PCR扩增...
昆虫消化道内是一个复杂的微生态系统， 有大量的微生物存在。这些微生物对寄主发育、 营养吸收和防御方面都起着重要的作用。本文利用基于16S rRNA基因的PCR-RFLP指纹图谱法和变性梯度凝胶电泳（denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE）的方法对柑桔黄龙病虫-媒柑桔木虱Diaphorina citri体内细菌菌群多样性进行了研究。经PCR-RFL...
本文测定了蛱蝶科7亚科27种蛱蝶和斑蝶科2种蝴蝶的线粒体16S rRNA基因部分序列，并从GenBank中下载了6种蛱蝶的同源序列。以斑蝶科的幻紫斑蝶和绢斑蝶作外群，通过遗传分析软件对这些序列进行了比较分析，用邻接法和贝叶斯法重建了蛱蝶科的系统发育树，探讨了蛱蝶科主要类群间的系统发育关系。序列分析的结果显示：经比对处理后获得494 bp长度序列，其中有可变位点206个，简约信息位点145个；A...
摘要：
在中国学者夏凯龄的分类系统中，剑角蝗科Acrididae一直被看作是单系群，包含6个亚科。但是，近年来的研究对其单系性争议较大。为探讨其单系性和剑角蝗属等6属的系统发育关系，我们测定了剑角蝗科14种蝗虫的16S rRNA基因部分序列，并从GenBank中下载了1种蝗虫的同源序列。以蚱科的2个种作外群，用NJ、MP及ML法重建系统发生树。由三棵分子系统树中得出的系统发生关系与中国的分类系统差...