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2024年8月5日,中国科学院生物物理研究所朱平研究组和李国红研究组,在《细胞研究》(Cell Research)上在线发表了题为Structural basis for linker histone H5–nucleosome binding and chromatin fiber compaction的研究论文。该研究获得了由连接组蛋白H5折叠十二个核小体形成的染色质颗粒3.6埃分辨率的冷冻电...
2024年6月12日,美国国立卫生研究院衰老研究所研究员Ranjan Sen课题组,首次揭示了衰老对免疫细胞中三维染色质组织的影响,并将其与B细胞的发育和其前体细胞的功能联系在了一起,展示了基因组学和三维染色质研究在揭示衰老机制方面的巨大潜力,提供了一种未来开发抗衰老疗法的可能方向。相关研究发表于《自然—细胞生物学》。
2024年4月20日,同济大学生命科学与技术学院的高绍荣/高睿/陈嘉瑜/杨光研究团队在Cell Reports上发表题为“Chromatin landscape instructs precise transcription factor regulome during embryonic lineage specification” 的研究论文,该研究揭示了以TFAP2C为中心的转录因子调控网络...
人类的基因组包含有约3万亿个DNA核苷酸,其中高达98%的DNA序列不编码任何功能产物,在过去被认为是“垃圾DNA”。随着科技的发展,研究者陆续发现,这些染色体上的“暗物质”隐藏着重要的生命调控信息。其中,长链非编码RNA(lncRNA)引起广泛关注。越来越多的研究发现,部分lncRNA可以编码短小的肽段,这些小肽参与各种细胞活动的调节。然而,目前在免疫细胞中报道的此类小肽的作用和机制还比较少。
合成基因组学通过设计与合成重塑基因组,既可以探索基因组的组织规律,也是改造基因组、创造人工生命的底盘技术。随着人们对基因组认识的不断深入和DNA合成技术的不断进步,合成基因组学已成为科学探索新前沿。非细胞生物和原核生物都已实现了基因组的人工合成。去年11月,国际酵母基因组合成计划(Sc2.0)宣布第二阶段重大进展,完成了全部16条染色体和一条特殊设计的tRNA新染色体的设计与合成。然而,多细胞生物...
DNA损伤应答与修复经历“进入-修复-恢复” (Access-Repair-Restore,ARR)三个生物学过程。核小体稳态对于DNA损伤应答及信号解除、基因转录瞬时激活与抑制至关重要。单就组蛋白赖氨酸乙酰化来说,乙酰化介导染色质松弛以便DNA修复推进或促进基因转录;去乙酰化则造成致密染色质结构以保护遗传物质不受损失或抑制基因转录,因此染色质松散被认为是DNA双链断裂修复(DSBs)的先决条件。...
衰老被认为是一种不可避免和不可逆转的生命过程,其特点是许多生理功能的逐渐衰退或改变,其中包括免疫系统和免疫功能。一方面,适应性免疫随着年龄的增长而下降,导致免疫功能老化;另一方面,天然免疫水平随年龄逐渐增高,与衰老和疾病尤其是神经退行性疾病密切相关。尽管年龄增长会导致全基因组范围内免疫相关基因的上调,但目前尚不清楚这种广泛水平的免疫上调是否仅仅是免疫反应随年龄累积的效应,还是这些基因在染色质水平上...
在国家重点研发计划和广东省领军人才等项目的支持下,中国科学院广州生物医药与健康研究院Alexander Strunnikov团队研究发现肿瘤-睾丸(Cancer-Testis,CT)基因能够造成持久的染色体不稳定现象。相关研究近日在线发表于《美国科学院院刊》(PNAS)。Boukaba Abdelhalim为该论文第一作者,Alexander Strunnikov为通讯作者。
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)刘江研究组和蒋岚研究组合作,在Cell Reports 杂志上发表了题为“Single-cell chromatin accessibility and transcriptome atlas of mouse embryos”的研究论文,绘制了小鼠胚胎单细胞染色质可及性(Chromatin accessibility)及转录组(Transcri...
癌细胞出现基因异常后,能够不受抑制地生长和增殖。近日,研究人员发现了癌细胞和正常细胞的另一个区别:X染色体。通常只在XX女性细胞中失活的X染色体,在不同的男性癌症中也可以失活。相关研究11月10日发表于《细胞系统》。
真核细胞中的染色体通常会在空间上折叠成有序的三维结构,包括区室(compartment)、拓扑相关结构域(Topological-Associated Domain, TAD)及染色质环(chromatin loop)等。这些结构广泛参与基因的表达调控,而结构异常则会导致发育异常甚至是肿瘤的发生。Compartment之间的互作在细胞命运转变过程中也会发生动态的变化。“环挤压”模型是目前被广泛认可...
细胞衰老是机体衰老的重要标志和驱动因素,其中表观遗传改变是细胞衰老的重要特征之一。细胞衰老通常表现为细胞核形态异常、核纤层蛋白结构紊乱以及核周异染色质的缺失。然而,细胞衰老过程中表观基因组的重塑规律以及基因表达改变的调控机制尚不明确。通过系统地绘制细胞衰老过程中不同层次的表观遗传图谱、解析细胞衰老的表观基因组变化规律,有望发现对衰老敏感的表观基因组位点和调控衰老的关键基因,从而为解码细胞衰老的分子...
疾病相关细胞如肿瘤细胞、纤维化细胞的起源细胞类型,是决定细胞命运和疾病表型的重要因素。起源细胞的分子特征可以保留在不断变化的异常细胞中,因此,识别疾病中异常细胞的细胞起源和分子特征,对于进一步理解疾病的发生发展机制具有极其重要的作用,也是进行疾病早期诊断和发现潜在治疗靶点的有效途径。
最新的癌症统计数据数据显示,前列腺癌位列全球男性肿瘤发病率第一位。虽然其五年生存率高达98%,但前列腺癌死亡病例数仍占所有男性恶性肿瘤死亡病例数的11%。前列腺癌致死的主要原因是部分患者在接受去势治疗后发展成了转移性的去势治疗抵抗前列腺癌(metastatic castration-resistant prostate cancer, mCRPC)。目前的研究表明,雄激素受体信号通路(androg...
2021年11月22日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员为人类基因组构建出单细胞染色质图谱。染色质是真核细胞中发现的由DNA和蛋白组成的复合物;在某些细胞核内,关键基因调控元件所在的染色质区域以开放的结构出现。在不同人类组织类型的细胞中精确地确定这些可访问的染色质区域将是理解基因调控元件(非编码DNA)在人类健康或疾病中的作用的重要一步。相关研究结...

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