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北京基因组所（国家生物信息中心）揭示共转录m6A修饰建立机制及其功能（图）
核酸结构 细胞分化
2024/4/22
2024年4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队合作在Molecular Cell在线发表了题为“DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability”的研究论文，揭示了三链核酸结构R-lo...
Cas12a属于II类V-A CRISPR系统，它是用CRISPR RNA (crRNAs)编程，通过RuvC结构域特异性识别和切割dsDNA或单链DNA (ssDNA)。Cas12a在识别其目标dsDNA时，可以释放单链脱氧核糖核酸酶(ssDNase)活性，不加区分地切割附近的ssDNA(即反式切割)。基于 CRISPR/Cas12a 系统的传感方法在恒温条件下就可以进行，不需要很高的温度，在一...
2020年4月15日，国际学术期刊BMC Biology在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与澳大利亚国立大学约翰克汀医学研究中心Thomas Preiss研究组的合作研究 — “Multiple links between 5-methylcytosine content of mRNA and translation”。
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构，在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能，包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等，但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高的修饰类型，广泛参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化、以及肿瘤生成和转移等生命过程。然而，目前...
汕头大学医学院专科生物化学与分子生物学课件第十一章 RNA生物合成转录。
汕头大学医学院五年制临床医学生化与分子生物学课件第八章 RNA的生物合成（转录）。
TRIM5α(tripartite motif protein 5-alpha)蛋白是恒河猴体内一种非常重要的限制因子，能抑制人免疫缺陷病毒(HIV-1, human immunodeficiency virus type 1)、马感染性贫血病毒(EIAV, equine infectious anemia virus)和猫免疫缺陷病毒 (FIV, feline immunodeficiencyv...
人类基因组中的反转录转座子
反转录转座子 人类基因组 人类疾病 反转录转座
2008/7/3
人类基因组中有35%以上的序列为转座子序列.反转录转座子是引起人类疾病的潜在病因.人类基因组中的主导转座子——L1反转录转座子内部有二个开放读框，其编码蛋白具有RNA结合蛋白、反转录酶和内切酶活性.L1可能通过靶引物反转录机制整合到染色体中；Alu等非自主性反转录转座子可能利用L1反转录酶的反式互补作用进行转座.
拟南芥抗旱转录因子CBF4基因区域的核苷酸多样性及其分子进化分析
拟南芥 CBF4基因 核苷酸多样性
2008/1/26
摘要 以生长于不同气候条件下的17个拟南芥核心生态型为材料，分析了它们的抗旱转录因子CBF4 基因区域的序列多态性。结果表明，拟南芥CBF4基因区域具有高密度的单核苷酸多态性（SNP）和插入缺失（Indel），多态性频率为每35.8 bp一个 SNP，每143 bp一个Indel，基因非编码区的多态性是编码区的4倍。在编码区，SNP的频率为每96.4 bp一个SNP，其中发现25 av、203 ...
摘要分别从重组质粒pUB1及其M13亚克隆S1中将7号淀粉酶链霉菌(Streptomyces diastaticus No.7)M1033(以下简称S. di. M1033)木糖异构酶基因的-192-+581bp片段克隆入链霉菌启动子探测质粒pIJ4083中,转化变铅青链霉菌(S.lividans) TK24。通过对其邻苯二酚加双氧酶活性的检测表明,该片段具有启动子活性。应用M13亚克隆S1和合成...
RNA聚合酶II中的CTD结构在mRNA转录和加工偶联过程中的重要作用
RNA聚合酶II CTD mRNA转录 mRNA加工
2007/12/30
摘要RNA聚合酶II最大亚基末端的羧基端结构域（CTD）是由以七氨基酸（-Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser- Pro-Ser-）为重复单位的高度保守的重复序列组成的。因其结构与功能上的特殊性，它在近年来受到学术界的广泛关注。诸多的实验表明，该结构可通过与mRNA加工因子的相互作用而对其加工过程产生直接或间接的影响，在mRNA的转录和加工的偶联过程中具有重要的作用。本文即是根据近年来的实验结果...
鲤鱼垂体mRNA反转录模板活性的研究
克隆 反转录酶
2007/12/21
摘要 本实验用不同方法研究鲤鱼垂体mRNA反转录为互补DNA的活性。用硫氰酸胍法,从垂体中提取总RNA,经过Oligo(dT)-纤维素柱层析,得到poly(A)~+RNA。 以mRNA为模板,30％反转录成单链cDNA。利用RNaseH-DNA聚合酶Ⅰ-E.coli DNA连接酶合成双链cDNA。单链cDNA拷贝成双链cDNA。经放射自显影分析,证明合成了全长cDNA。用水解法合成双链cDNA,大...
大鼠肝tRNA~(Ile)基因的克隆与体外转录
tRNA~(Ile)基因 克隆 体外转录
2007/12/20
摘要 采用PCR扩增出大鼠肝tRNAIle基因，构建了重组质粒pGWIW，并用T7RNA聚合酶／启动子系统对其进行了体外表达．经过对转录产物片段大小及运用Northernblot鉴定，证明获得了不含修饰核苷酸的大鼠肝tRNAIle生物学活性检测显示：合成基因体外转录产物氨基酰化活性是天然tRNA的40％，提示修饰核苷酸在哺乳动物Ile－tRNA合成酶的识别过程中起重要作用
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靶向转录因子AP-2的Decoy核酸对肿瘤细胞增殖的抑制作用
转录因子AP-2 decoy核酸 转录调控 肿瘤
2007/12/20
摘要 ecoy核酸是与靶转录因子具有高亲和性的双链寡聚核酸 ,通过竞争性抑制转录因子与调控区域的结合 ,调控转录来改变下游基因的异常表达 ,从而抑制肿瘤恶性增殖 .用MTT比色法 ,体外筛选结合转录因子AP 2的decoy核酸药物 ,结果K2 0 6对多种肿瘤细胞生长有显著的抑制作用 ,在异植人肿瘤细胞NCI H4 6 0的裸鼠模型中 ,静脉注射高中低三剂量组的decoy核酸K2 0 6 ,抑瘤率...
一种快速mRNA差异显示技术及用于分离辐射诱导转录子
ｍＲＮＡ差异显示 反转录ＰＣＲ 辐射诱导基因
2007/12/17
摘要 介绍一种从不同类型细胞或不同生长状态细胞中分离差异表达基因的快速ｍＲＮＡ差异显示技术．其特点是不用同位素标记，操作简便，在普通琼脂糖凝胶电泳中就能分辨差异显示的ｃＤＮＡ带，便于ＤＮＡ回收和进一步重组克隆．用此方法成功地分离到电离辐射诱导转录子．