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Genomic analyses reveal the genetic basis of early maturity and identification of loci and candidate genes in upland cotton (Gossypium hirsutum L.)
陆地棉 全基因组 重测序方法 SNP变异图谱
2024/5/17
本研究利用收集的436份国内外变异广泛的陆地棉材料，采用全基因组重测序方法，构建了群体的SNP变异图谱，通过对包含136份早熟棉资源在内的356份陆地棉材料进行深度重测序，并结合公共数据库中的80份陆地棉材料共获得了10,118,884个高质量的SNPs。利用全基因组关联分析（GWAS）鉴定到控制陆地棉早熟性的307个显著遗传位点和重要调控基因。两个早熟遗传热点区域位于 D03和A05&...
The genomic basis of geographic differentiation and fiber improvement in cultivated cotton
栽培陆地棉 纤维品质 优异位点 分子育种
2024/4/16
栽培陆地棉广泛种植于世界各地，是最重要的天然纤维来源，纤维品质直接决定了其经济价值。国内外棉花育种家开展了广泛的远缘杂交工作，将许多稀有的重要基因转移到栽培陆地棉中提高纤维品质，但并未对这些基因进行深入研究。本研究分析了超过3000份棉花种质资源，总计调查了近80000个纤维品质数据，全面剖析和评估了现存陆地棉种质资源中纤维品质相关的优异位点，并从远缘杂交渐渗系中鉴定到两个新的与纤维品质密切关联的...
Genomic and transcriptomic analysis reveal molecular basis of salinity tolerance in a novel strong salt-tolerant rice landrace Changmaogu
Rice landrace Salt tolerance BSA-seq Transcriptome sequencing
2023/4/21
Salt stress is an important factor that limits rice yield. We identified a novel, strongly salt tolerant rice landrace called Changmaogu (CMG) collected from a coastal beach of Zhanjiang, Guangdong Pr...