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山东大学生命科学学院谭保才教授课题组揭示玉米WD40蛋白SHREK1调控核糖体pre-rRNA加工新机制（图）
山东大学生命科学学院 谭保才 玉米 WD40蛋白 SHREK1 核糖体 pre-rRNA The Plant Cell 植物种子发育
2022/12/23
近日，The Plant Cell在线发表了山东大学生命科学学院谭保才课题组题为“Maize Shrek1 encodes a WD40 protein that regulates pre-rRNA processing in ribosome biogenesis”的研究论文。该研究揭示了玉米WD40蛋白SHREK1参与核糖体pre-rRNA加工并影响籽粒发育的分子机制。
2020年5月22日，中国医科大学药学院魏敏杰/吴慧哲课题组在《Molecular Cancer》发表文章“Long noncoding RNA ZFAS1 promoting small nucleolar RNA-mediated 2’-O-methylation via NOP58 recruitment in colorectal cancer”。《Molecular Cancer》影响因...
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室在改进细菌16S rRNA基因高通量测序方法研究上有新进展（图）
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室 细菌 16S rRNA 基因高通量测序 微生物组
2020/6/5
近日，华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室谢卡斌课题组在Microbiome发表了题为“Engineering CRISPR/Cas9 to mitigate abundant host contamination for 16S rRNA gene-based amplicon sequencing”的研究论文，论文报道了一种改进的细菌16S rRNA基因高通量测序方法。
蛋白质-RNA相互作用引导新生rRNA折叠（图）
蛋白质 RNA 相互作用 新生rRNA折叠
2019/12/19
近日，美国斯克里普斯研究所等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Transient Protein-RNA Interactions Guide Nascent Ribosomal RNA Folding”的文章，揭示了短暂的蛋白质-RNA相互作用引导新生核糖体RNA折叠。核糖体组装是一种高效、复杂和异构的过程，在转录过程中核糖体蛋白组装至新生rRNA上。但新生RNA折叠与蛋白质结合之间的相...
为了探讨我国绵羊痒螨兔亚种的遗传变异特征和种群结构，利用PCR技术对我国5个地理区域（华北、华东、华中、西南、西北）的83个绵羊痒螨兔亚种株的线粒体16S rRNA全序列进行扩增和遗传多样性分析。结果显示，83个样品的16S rRNA全序列长度均为1 025 bp，共存在83个变异位点和52个单倍型；样品所代表的5个地理区域种群间的Fst值为-0.037 59~0.587 63，基因流值为-6.9...
法医微生物是目前法医学研究的前沿热点之一。16S rRNA基因由于其保守性与特异性并存的特点，是法医学鉴定的理想标记。伴随着高通量测序技术的快速发展，对微生物的研究已逐步应用于环境、医疗等多个领域。在法医学领域，以16S rRNA基因测序为代表的法医微生物研究成果也逐步应用于法医学实践中的生物检材鉴定、个体识别、死亡时间推断、地域推断等方面，为案件的侦查提供线索，为传统方法作为补充和辅助。本文阐述...
通过检测嗜尸性蝇类28S rRNA基因中715 bp序列，鉴定常见嗜尸性蝇类种属，解决其形态学鉴定难题，为死亡时间推断提供技术支持。 方法 收集洛阳地区常见嗜尸性蝇类标本29只，经形态学鉴定后，用Chelex-100法提取腿部DNA，并对28S rRNA基因片段进行扩增和测序，与GenBank和EMBL数据库中的28条相应蝇种序列进行比对，用MEGA7.0软件进行序列整理，通过BLAST搜索进行序...
【目的】探明灰飞虱Laodelphax striatellus体内细菌的群落结构和种类多样性。【方法】采用Illumina MiSeq测序平台对新羽化24 h的灰飞虱雌雄成虫体内细菌16S rRNA的V3-V4 变异区序列进行高通量测序，应用USEARCH 和Silva等软件和数据库来统计样品序列数目和操作分类单元(operational taxonomic unit, OTU) 数量，分析灰飞虱...
以羊圈空气微生物为研究对象，了解羊圈空气中细菌群落结构以及致病菌属特征。将来自10个不同羊场的羊圈空气样本，应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定羊圈空气中细菌的16S rRNAV3-V4变异区序列，分析不同空气样本细菌群落组成。结果显示：空气样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为33 408，涵盖了25门、66纲、123目、253科、547属、444种的细菌。通过微生物多...
基于PCR-DGGE和拟杆菌(Bacteroides)16S rRNA的岩溶地下水粪便污染来源示踪研究:以重庆南山老龙洞地下河系统为例
岩溶地下水 粪便污染 大肠菌群 拟杆菌 PCR-DGGE
2016/12/7
岩溶地下水的微生物污染日益严重,其来源的研究得到国际学术界的广泛关注.本研究以重庆南山老龙洞岩溶地下河系统为对象,采用滤膜法监测地下水中的总细菌、大肠杆菌、粪大肠菌及粪链球菌等微生物指标,以拟杆菌(Bacteriodes)为指示细菌,采用PCR-DGGE示踪地下水中大肠杆菌／粪大肠杆菌的来源.结果表明,老龙洞地下河流域各类细菌含量严重超标,总细菌数为10~2.9×107CFU·mL-1,大肠菌群总...
Comparison of Fecal Microbiota of Mongolian and Thoroughbred Horses by High-throughput Sequencing of the V4 Region of the 16S rRNA Gene
Fecal Microbiota 16S rRNA Gene High-throughput Sequencing Mongolian Horses
2016/11/10
The hindgut of horses is an anaerobic fermentative chamber for a complex and dynamic microbial population, which plays a critical role in health and energy requirements. Research on the gut microbiota...
对光滑河蓝蛤Potamocorbula laevis，黑龙江河蓝蛤Potamocorbula amurensis，焦河蓝蛤Potamocorbula ustulata，红肉河蓝蛤Potamocorbularub romuscula 4个野生种共40个个体的线粒体COI 和16S rRNA基因片段进行了扩增和测序，经过筛选和剪切，得到长度为650 bp和450 bp的片段。序列分析显示，序列的碱基组...
Characterization of the Fecal Microbial Communities of Duroc Pigs Using 16S rRNA Gene Pyrosequencing
Duroc Pigs Fecal Microbiota 16S rRNA Gene Pyrosequencing
2016/5/18
This study characterized the fecal bacterial community structure and inter-individual variation in 30-week-old Duroc pigs, which are known for their excellent meat quality. Pyrosequencing of the V1–V3...
Rapid Origin Determination of the Northern Mauxia Shrimp (Acetes chinensis) Based on Allele Specific Polymerase Chain Reaction of Partial Mitochondrial 16S rRNA Gene
Allele-specific Polymerase Chain Reaction Origin Identification
2016/5/18
Acetes chinensis is an economically important shrimp that belongs to the Sergestidae family; following fermentation, A. chinensis′ economic value, however, is low in China, and much of the catch in Ch...