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搜索结果: 1-6 共查到医学 EST-SSR相关记录6条 . 查询时间(0.061 秒)
对NCBI数据库中210 878条高粱EST序列进行处理, 得到57 498条无冗余EST序列, 经SSR搜索, 发现3 338个SSR分布于3 116条EST序列中, 分布频率为1/11.28 kb, 包括215种基元重复类型。其中三核苷酸重复最高, 占68.33%, 二核苷酸重复占17.97%。3 338条SSR序列中有1 694条序列能够设计出引物, 所占比例为50.75%。选取14对引物进...
为了深入研究绵羊皮肤源EST-SSR分子标记的潜在基因功能, 文章采用比较基因组学和生物信息学方法对本实验室前期开发的9个绵羊皮肤源EST-SSR多态位点原始EST进行了功能注释和电子定位。研究结果表明, 6个位点的原始EST与已知基因高度同源, 其中3个基因可能对毛性状具有重要调控作用。通过与牛全基因组cDNA文库的比对, 将8个位点初步定位于牛染色体上, 并基于牛、绵羊已定位的共用标记计算了染...
为了深入研究绵羊皮肤源EST-SSR分子标记的潜在基因功能, 文章采用比较基因组学和生物信息学方法对本实验室前期开发的9个绵羊皮肤源EST-SSR多态位点原始EST进行了功能注释和电子定位。研究结果表明, 6个位点的原始EST与已知基因高度同源, 其中3个基因可能对毛性状具有重要调控作用。通过与牛全基因组cDNA文库的比对, 将8个位点初步定位于牛染色体上, 并基于牛、绵羊已定位的共用标记计算了染...
通过球孢虫草、蛹虫草EST设计EST-SSR引物,建立虫草属EST-SSR标记系统。 方法 :从NCBI公共数据库下载获得虫草EST,利用Sequece Seiners 1.2软件去除冗余序列并设计引物,进行PAGE电泳。 结果 :通过去除EST总序列中低质量的和冗余的序列后,得到全长为2 953 173 bp的4 556条无冗余球孢虫草EST。从中发掘出718个EST-SSR,分布于616条ES...
通过对不同三七选育品系的遗传变异和遗传分化程度进行分析比较,为三七的品种选育提供理论依据。 方法 :利用自行设计和他人开发的17对EST-SSR引物,对来自4个不同区域的17份三七选育品系进行遗传多样性及遗传分化分析。 结果 :在17份三七选育品系中一共扩增出136个多态位点,平均多态信息量PIC值为0.78,Nei's基因多样性H 0.139,Shannon多样性指数I 0.208。选育品系间的...
建立新近较高覆盖度丹参EST-SSR分子标记,为不同产地来源丹参居群的遗传变异分析奠定基础。 方法 :对截止2010年11月 Genbank下载的丹参EST序列结合HMPL实验室获取的共计1 408条EST序列,进行处理,获取高质量EST序列;经SSRIT软件搜索、分析EST序列中SSR位点的分布规律及类型;在此基础上,运用Websat软件设计EST-SSR引物,经对不同产地丹参样本DNA模板的P...

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