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三种稻飞虱体内类酵母共生菌18S rDNA和 ITS5.8S rDNA序列克隆及进化分析
稻飞虱 灰飞虱 褐飞虱 白背飞虱 酵母类共生菌 18S rDNA ITS-5.8S rDNA 系统发育分析
2013/9/14
为研究水稻3种主要害虫灰飞虱Laodelphax striatellus、 褐飞虱Nilaparvata lugens和白背飞虱Sogatella furcifera体内类酵母共生菌(yeast-like symbiotes, YLS)的种属地位及与寄主的进化关系, 测定了其体内YLS的18S rDNA及ITS-5.8S rDNA的全长序列。基于3种稻飞虱体内YLS的18S rDNA序列比对表明,...
基于两个叶绿体基因(matK和rbcL)和一个核糖体基因(18S rDNA)的序列分析, 对代表了基部被子植物和单子叶植物主要谱系分支的86科126属151种被子植物(单子叶植物58科86属101种)进行了系统演化关系分析。研究结果表明由胡椒目Piperales、樟目Laurales、木兰目Magnoliales和林仙目Canellales构成的真木兰类复合群是单子叶植物的姐妹群。单子叶植物的单系...
基于18S rDNA序列的蝽次目(半翅目:异翅亚目)
分子系统发育 蝽次目 18S rDNA 毛点类
2009/6/23
利用18S rDNA分子约1 912 bp的序列对蝽次目21个科53个种进行系统发育分析。运用MP法、ML法和NJ法分析后的结果表明:蝽次目的单系性得到很高的支持;扁蝽总科成为毛点类的姐妹群;毛点类基本确定为两大分支:一支包含蝽总科和红蝽总科;另一支主要由长蝽总科、缘蝽总科和南蝽总科组成;长蝽总科和缘蝽总科都是多系;长蝽总科中,跷蝽科和皮蝽科的关系最近,构成姐妹群,位于整个毛点类的基部;与长蝽总科...
产脂肪酶酵母的筛选及其18S rDNA序列分析
脂肪酶 酵母 18S rDNA 进化树
2012/11/9
从新疆石河子地区10分土样中,利用罗丹明B为指示剂,筛选到了90株有脂肪酶活性的酵母菌.滴定法测量野生菌株酶活,每毫升培养液酶活为1.1~6.6U,其中B9,C1,E7,F12等有成为生物催化剂的潜力.扩增了其中脂肪酶活性较高的9株的18SrDNA,测序后BLAST比对,并进行系统进化树分析,表明所得菌株分别与Candida,Rhodotorula,Trichosporon等属亲缘关系接近.进行部...
灰飞虱类酵母型共生菌18S rDNA序列变异及系统发生
灰飞虱 类酵母型共生菌 18S rDNA序列 进化 系统发育
2008/2/5
摘要分离纯化了云南楚雄、宁夏银川、北京通县、上海七宝镇、四川西昌5个地区的灰飞虱体内类酵母型共生菌(Yeast-like Symbionts,YLS),并对其18S rDNA的约600bp的序列进行了测定。结合已有的序列,构建了不同宿主的YLS的分子系统树。结果表明,灰飞虱的YLS属于子囊菌亚门Pyrenomy cetes纲,与此纲的H.chrysospermus亲缘关系最近。我国各地区及日本的灰...
基于18S rDNA的蝗总科分子系统发育关系研究及分类系统探讨
18S rDNA的蝗总科分子 发育
2007/12/10
将自测的我国直翅目蝗总科7科7种和从GenBank中下载的17种直翅目昆虫的18S rDNA序列片段进行了同源性比较,用似然比检验的方法对序列比对结果进行了碱基替代模型的选择,以蚱总科的Paratettix cucullatus和蜢总科的Stiphra robusta作外群,用NJ、MP、ML和贝叶斯法构建了分子系统树。在获得的1 849 bp的序列中,有205个变异位点,74个简约信息位点; ...
题目:褐飞虱不同致害性种群体内共生菌18S rDNA部分序列比较
作者:张珏锋, 吕仲贤, 陈法军, 陈建明, 郑许松, 徐红星, 陈列忠, 俞晓平
摘要:
分离纯化了褐飞虱3种不同致害性种群体内类酵母共生菌 (yeast-like symbionts, YLS),并对其18S rDNA基因序列进行了比较。结果表明,褐飞虱3种不同致害性种群体内类酵母共生菌18S rDNA均扩增出600 bp左右...
Composition and temporal variability of picoeukaryote communities at a coastal site of the English Channel from 18S rDNA sequences
Composition and temporal variability picoeukaryote communities coastal site of the English Channel 18S rDNA sequences
2014/5/14
We analyzed picoeukaryote assemblages at a French coastal site of the English Channel by sequencing cloned eukaryotic 18S rRNA genes in eight genetic libraries constructed from environmental samples (...
Abundance and diversity of prymnesiophytes in the picoplankton community from the equatorial Pacific Ocean inferred from 18S rDNA sequences
Abundance and diversity picoplankton community equatorial Pacific Ocean 18S rDNA sequences
2014/6/17
Picoplankton, i.e., cells smaller than 2-3 mm, dominate in most open oceanic regions, such as in the Pacific Ocean. In these areas, the dominant carotenoid of photosynthetic eukaryotes is 199-hexanoyl...